とある独裁国家・東ドロアは、自国の歌手クイーン・マルタが、隣国・西ドロアで暗殺された事件を契機に、西ドロアと一触即発の緊張状態が続いていた。そんな東ドロアから秘宝「リトルコメット」を盗み出すため潜入したルパン三世と次元大介は見事お宝を盗み出すが、何故か行く先々に警察が待ち構えており、街中で狙撃により命を狙われる危険な状況に陥ってしまう。

物語の終盤、自身の射撃の腕に絶対の自信を持つ殺し屋・ヤエルと、ついに次元が対峙する。